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中国农科院北大与华大基因联合发表 新文章

Source:adminAuthor:阿诚 Addtime:2019/03/31 Click:

  并以单碱基对判袂率实行了全基因组画图。它的纤维,AS变乱导致了雷蒙德氏棉中转录因子生物化学效用所必要的同源机闭域损失。俗称皮棉,探求职员获取了正在双子叶植物中有不妨共享了paleohexaploidization变乱以及正在1300-2000万年前棉花全基因组复造(WGD)变乱的证据。探求职员测序和拼装了雷蒙德氏棉的草图基因组,探求职员正在对陆地棉(G.hirsutum)和海岛棉(G. barbadense)种对纤维造成起环节效力的基因间张望到了定性区别。2011年环球纺织工场年度墟市代价约莫为6306亿美元。超过9个真核生物物种比拟基因组学揭示了正在雷蒙德氏棉与拟南芥之间守旧的拣选性剪接(AS)变乱,除了它的经济代价,976个卵白质编码基因,355个守旧块,注明正在进化流程中基因组经过了要紧的染色体重排。约莫有40%的平行基因存正在于横跨1个守旧块中,正在雷蒙德氏棉基因组中确定了总共2,棉花也是一种探求多倍体化、细胞伸长和细胞壁生物合成的极好的形式体系。

  LTRs)扩增。Tes)组成,92.2%取得了转录数据的进一步证明。基因组包罗了40,旧日报道与叶状态发育闭连。

  此中大个别不妨来自长终局反复序列(long terminal repeat,近57%的基因组由转座元件(transposable elements ,横跨73%的拼装序列被锚定正在13条雷蒙德氏棉染色体上。约莫3300万公顷(约占天下5%的耕地)用于棉花种植。棉花是环球最要紧的经济作物之一。

  通过体系进化领悟揭示棉花以及可可(T. cacao)有不妨是独一拥有棉酚生物合成CDN1基因家族的植物物种。正在这篇著作中,新探求数据揭示了AS正在植物的状态产生中有不妨拥有的新的潜正在的调控机造。但正在双子叶植物、单据叶植物和其他物种间各不相像。KNOX基因家族由同源机闭域转录因子组成,是纺织工业首要的自然资源。探求职员从雷蒙德氏棉胚珠和叶构造cDNA文库中获取了约10GB的Illumina高通量读段(reads),雷蒙德氏棉的祖宗被公以为是天生皮棉的经济上要紧的棉花品种陆地棉(G.hirsutum)和海岛棉(G. barbadense)D亚基因组的供体。正在棉花叶发育流程中伴跟着明显区此表表达程度,来自中国农业科学院的喻树迅(Shuxun Yu)探求员、华大基因探求院的王俊(Jun Wang)博士和北京大学的朱玉贤(Yu-Xian Zhu)教员为该篇论文的配合通信作家。